Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slit2Q9R1B9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slit2Q9R1B9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms