Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pcm1Q9R0L6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcm1Q9R0L6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms