Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NrkQ9R0G8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NrkQ9R0G8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NrkQ9R0G8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms