Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Plod1Q9R0E2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Plod1Q9R0E2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms