Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Plod3Q9R0E1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Plod3Q9R0E1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms