Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lamc3Q9R0B6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Lamc3Q9R0B6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Lamc3Q9R0B6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms