Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atp11cQ9QZW0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp11cQ9QZW0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms