Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms