Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcf1Q9QZM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms