Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copg1Q9QZE5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Copg1Q9QZE5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms