Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Trpc3Q9QZC1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpc3Q9QZC1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Trpc3Q9QZC1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trpc3Q9QZC1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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