Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Exo1Q9QZ11 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Exo1Q9QZ11 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms