Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx4Q9QY61 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Irx4Q9QY61 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms