Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pkp3Q9QY23 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pkp3Q9QY23 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms