Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxe3Q9QY14 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxe3Q9QY14 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms