Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpsf3Q9QXK7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpsf3Q9QXK7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms