Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Limd1Q9QXD8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Limd1Q9QXD8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms