Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clca3a1Q9QX15 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clca3a1Q9QX15 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms