Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Homer2Q9QWW1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Homer2Q9QWW1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms