Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Chaf1aQ9QWF0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms