Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcea2Q9QVN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcea2Q9QVN7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms