Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mid2Q9QUS6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mid2Q9QUS6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms