Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Txnrd1Q9JMH6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Txnrd1Q9JMH6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Txnrd1Q9JMH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Txnrd1Q9JMH6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms