Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vstm2bQ9JME9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vstm2bQ9JME9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms