Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cabp5Q9JLK3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cabp5Q9JLK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms