Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TefQ9JLC6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TefQ9JLC6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms