Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtsmQ9JL96 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtsmQ9JL96 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms