Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc5a3Q9JKZ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms