Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot9Q9JKY0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cnot9Q9JKY0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms