Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Scamp4Q9JKV5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms