Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Habp4Q9JKS5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Habp4Q9JKS5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms