Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx5Q9JKQ4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx5Q9JKQ4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms