Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms