Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nectin1Q9JKF6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms