Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trem1Q9JKE2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms