Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Uchl3Q9JKB1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Uchl3Q9JKB1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms