Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pard6bQ9JK83 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pard6bQ9JK83 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms