Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Msgn1Q9JK54 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Msgn1Q9JK54 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms