Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddx20Q9JJY4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ddx20Q9JJY4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ddx20Q9JJY4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms