Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Alyref2Q9JJW6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms