Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PigbQ9JJQ0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms