Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Smad9Q9JIW5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms