Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Yipf7Q9JIM5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms