Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EefsecQ9JHW4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms