Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ClpxQ9JHS4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ClpxQ9JHS4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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