Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc9a3r2Q9JHL1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms