Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmod3Q9JHJ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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