Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET80

Jph1, Junctophilin-1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph1Q9ET80 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Jph1Q9ET80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jph1Q9ET80 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms