Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim39Q9ESN2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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