Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Usp29Q9ES63 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp29Q9ES63 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp29Q9ES63 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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